Der Kreisverband Harz ist in den Kreisvorstand, seine Mandatsträger*innen und die Regionalgruppen unterteilt.
Der Kreisvorstand koordiniert sowohl die politische als auch organisatorische Arbeit des Kreisverbandes und überwacht die Tätigkeiten der Regionalgeschäftsführung.
Die Mandatsträger*innen repräsentieren die Ideen der Partei BÜNDNIS 90/DIE GRÜNEN im Kreistag, den Stadträten und Ortschaftsräten.
In den Regionalgruppen Halberstadt, Quedlinburg und Wernigerode werden die politischen Geschehnisse vor Ort abgestimmt.